Of het nu gaat om halal-productie, opslag, verwerking of transport van goederen, bij halal-controle draait alles om het zo veel mogelijk verminderen van risico’s. In geen geval mag er kruisbesmetting plaatsvinden tussen halal- en niet-halal-goederen. Binnen de transportsector kan op veel verschillende manieren kruisbesmetting plaats vinden. De meest klassieke vorm van transport is vrachtwagentransport. Andere transportwijzen waarbij contact plaats kan vinden, is het vervoeren van vloeistoffen in tankervrachtwagens. Bij dit soort export wordt goed gekeken naar de geschiktheid van verpakkingmaterialen, ruimte(gebrek), aard van product, enz.. De combinatie van deze en andere factoren geven een beeld van de mogelijke risico´s op kruisbesmetting.

Een halal-certificaat wordt kan worden afgegeven voor het bedrijf als geheel, waarbij verklaard wordt dat het transportbedrijf bevoegd is om halal-producten te vervoeren. Er kan ook gekozen worden voor een ‘deelcertificaat’ waarbij uitsluitend het vervoer van specifieke producten wordt toegestaan, die dan uitdrukkelijk op het certificaat worden vermeld.